羊结核病的病原为结核杆菌，属于分支杆菌属。主要包括人型结核分枝杆菌、牛型结核分枝杆菌和禽型结核分枝杆菌。牛型结核分支杆菌毒力较大，常能引起各种家畜的全身性结核，也是山羊结核病的主要传染来源；禽型结核分枝杆菌也可能是羊结核病的病原，绵羊最为易感。